Манускрипт написан неизвестным автором на непонятном языке. Всего книга содержит 246 пергаментных страниц, покрытых текстом и иллюстрациями. Предположительно, 28 страниц из книги вырвано. Свое название манускрипт получил благодаря Вилфриду Войничу, который в 1912 году обнаружил его среди прочих документов в иезуитском колледже, расположенном неподалеку от Рима.

Путь книги удалось проследить с середины 16 века, когда ее приобрел для своей коллекции император Рудольф II. После этого манускрипт сменил нескольких хозяев, пока не оказался в библиотеке колледжа. Сегодня необычная книга хранится в Йельском университете.

Относительно языка, на котором написан манускрипт, дискуссии ведутся до сих пор. Некоторые считают, что это видоизмененная латынь, в слова которой вставлены лишние буквы. Другие филологи придерживаются версии, что текст написан на древнееврейском языке путем изменения формы и вариантов написания слов.

Французский криптолог Жак Ги обратил внимание на то, что язык манускрипта напоминает своей структурой китайский или вьетнамский. Однако специалисты по восточным языкам так и не смогли идентифицировать данный диалект. Косвенным подтверждением данной теории служит тот факт, что некоторые растения, изображенные на страницах манускрипта, в Средние века росли только в Китае.